龟头发凉可能是由于阴茎充血少，在勃起的时候，阴茎有时会有点充血，所以摸起来可能是闷的。如果阴茎疲软，或者是阴茎处于紧缩状态下，龟头的温度感觉可能会偏凉。但是并不代表有问题，并不能说明阴茎的功能就有问题。
阴茎分两部分，即阴茎海绵体和尿道海绵体。龟头其实是属于尿道海绵体的延续庞大，所以并不像阴茎海绵体那样会有明显的血液充盈。
在勃起的时候，充血的是海绵体组织，龟头可能会有轻度充血，但是动脉血液灌注并不会像阴茎海绵体那样明显，所以龟头并不会有明显的热感。其实有些男性觉得龟头发凉，可能就是一种自我的感觉。
曾经在临床就见到有的男性觉得自己的龟头非常凉，但是勃起功能正常，只是觉得龟头凉不舒服，但是通过任何检查也查不到龟头发凉的原因。所以一般认为龟头发凉可能与阴茎充血不足，或者是阴茎收缩、血液灌注少可能有关系，龟头凉并不会影响阴茎的功能。